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nx의 graph를 pygraphviz로 변경해서 그리기
간단합니다. 보통 때는 상관이 없는데, tree 구조를 그릴 때는 graphviz의 레이아웃이 그림이 더 이쁘거든요. 그래서 간단하게 변경하는 코드를 추가합니다. 두잇 간단합니다. 밑에 주석처리한 코드는 그림을 원하는 곳에 저장하고 싶을 때 씁니...
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·⏱ 8m
nx의 layout을 rescaling합니다.
rescaling layout networkx로 네트워크를 시각화할 때 다양한 layout을 씁니다. 보통 쓰는 spring, spectral, shell 등의 레이아웃에는 문제가 없는데, 아래와 같은 layout을 사용할때는 0.0과 1.0사이...
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·⏱ 3m
nx.graph가 tree일 때 root, level 찾기
tree에서 Root 찾기 networkx의 를 사용해서 tree를 만들고 관리하는데, 그때 적절한 root를 찾는 것이 중요해요. 또 해당 root를 중심으로 다른 node들이 얼마나 멀리 떨어져 있는지를 파악하는 것도 중요하구요. 그래서 아래...
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·⏱ 8m
networkx graph tree 구조 예쁘게 그리기
tree에 적합한 layout을 찾습니다. networkx에는 다양한 layout이 있습니다만, tree 구조에 적합한 레이아웃은 없어요(정확히는 없다고 생각했습니다). 그런데 사실 없다는게, 제 입장에서는 말이 안되서 한참 찾았는데, 찾다보니 ...
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·⏱ 5m
networkx의 random tree 만드는 함수 정리
random하게 tree를 만듭니다. 예전에 제가 직접 random하게 tree를 만들어주는 코드를 만들었습니다. random하게 각 level별 node의 수를 정하고 children의 수도 랜덤하게 정해서 진행했는데, 생각보다 만드는데 시간이...
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·⏱ 44m
5년동안 수집한 개인 인간관계 데이터를 분석합니다.
인간관계를 분석합니다. 이번에 파이콘 한국 2018에서 발표하게 되어 발표자료를 준비하고 있습니다. 일단 여기에는 그림은 들어가지 않을 예정이고, 코드만 정리해서 보여줄 예정입니다. 발표자료는 여기서 보실 수 있습니다. 아무래도 필요한 부분들을 ...
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·⏱ 3m
DiGraph를 arrow로 그립시다.
DiGraph DiGraph는 방향성이 있는 네트워크를 말합니다. 일반적인 graph라면 edge를 그냥 그리면 되는데, 방향성이 있는 graph는 화살표를 잘 그려줘야 합니다. arrow style은 여기에 볼 수 있는데, 각각 어떻게 나오는지...
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·⏱ 11m
networkx로 random tree 만들기
random tree 만들기 random tree를 만들거에요. tree라는 것은 parent, children를 가지는 스트럭쳐죠. 저는 parent, children로 node를 접근하는 건 만들지 않았습니다만, random 하게 tree를 ...
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nx에서 random bipartite graph만들기
havelhakimigraph networkx에 라는 랜덤한 bipartite 그래프 생성기가 있습니다. 만약 bipartite set가 각각 5개, 3개 라면, 그 크기의 각 node의 deg sequence를 넘겨주면 그 deg들에 맞는 gr...
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networkx에서 graph를 만들고 relabeling하기
노드를 바꿔주기 networkx에는 꽤 괜찮은 random graph generator들이 많이 있습니다. 단 만들 때부터 node set를 정하고 만들기는 조금 어려워요. 그렇다면 일단 만든 다음에 바꿔주면 됩니다 하하핫 쉽죠. 바꿔주는 방법이...
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·⏱ 7m
networkx의 bipartite 다루기
bipartite graph bipartie graph는 set A와 set B 간에는 연결되는데, A의 node a들 끼리 연결되거나, B의 node b들 끼리 연결되는 일이 없는 경우를 말합니다. 예를 들면, set A는 사람이고, set B...
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·⏱ 28m
네트워크에서 비슷한 그룹을 찾아봅시다.
네트워크에서 community 찾기 일단 이건 일종의 clustering이라고 생각하셔도 상관없습니다. 일단 점과 선으로 된 네트워크를 구성했을 때, 비슷한 집단끼리 묶어보고싶잖아요. 전체 네트워크만 보는 건 큰 의미가 없으니까 이걸 좀 비슷한 ...
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·⏱ 2m
networkx의 노드, edge의 attribute 추가 및 업데이트하기
아주 간단합니다. 사실 너무 간단해서 굳이 이걸 포스팅할 필요가 있는가 라는 생각도 들긴 하는데..... 다음처럼 해당 node의 정보값(정확히는 attr dictionary)에 그대로 넣어주면 됩니다. 단 edge는 tuple이 key값으로 들어감
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·⏱ 10m
networkx의 layout 정리하기
네트워크를 다양한 레이아웃에 따라서 2차원에 그리기. 에서 , 등으로 그림을 그릴 때는 이미 axis에서 어떤 좌표에 그림을 그리면 될지가 명확하게 나와 있습니다만, network에서는 개별 node에 좌표값이 없기 때문에 어디에 그려야 하는지 ...
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·⏱ 51m
R&D knowledge map again
후 키워드 네트워크부터 다시 합시다. 데이터 전처리부분은 거의 다 한 것 같아요. 맨 끝에 설명하겠습니다. 이제는 정말 단일한 데이터 집단을 모은게 아닐까 싶습니다. 키워드 네트워크를 구성했을 때, 만든 네트워크에서 잘못된 노드 들이 있는 경우가...
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·⏱ 5m
understand networkx better.
일반적으로 쓰는 networkx 의 function들은 centrality, draw, add/remove node and edges 가 다인데, 이 외에도 꽤나 유용한 함수들이 많이 있습니다. 이것들을 좀 정리해두는 것이 필요하다고 생각됨. n...